Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone

CAS 14487-05-9  ·  C39H47NO14  ·  MW 753.8 g/mol

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Modèle 3D Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone, CAS 14487-05-9, formule brute C39H47NO14, masse molaire 753.8 g/mol

Vues du modèle

  • Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone (CAS 14487-05-9) – modèle 3D boules et bâtonnets, MolGod Viewer
    modèle 3D boules et bâtonnets
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    modèle 3D squelettique
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    modèle 3D compact (space-filling)
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    structure 2D

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À propos de Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone

Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone est un composé chimique enregistré sous le numéro CAS 14487-05-9, de formule brute C39H47NO14, et de masse molaire 753.8 g/mol.

La molécule contient 101 atomes reliés par 105 liaisons chimiques. Le nom systématique IUPAC complet de ce composé est [(7'S,9'E,11'S,12'R,13'S,14'R,15'R,16'R,17'S,18'S,19'E,21'Z)-2',15',17'-trihydroxy-11'-methoxy-3',7',12',14',16',18',22'-heptamethyl-4,6',23',29'-tetraoxospiro[1,3-dioxolane-2,27'-8,30-dioxa-24-azatetracyclo[23.3.1.14,7.05,28]triaconta-1(28),2,4,9,19,21,25-heptaene]-13'-yl] acetate. Le modèle 3D interactif ci-dessus permet de visualiser l'arrangement spatial des atomes — vous pouvez le faire pivoter à la souris, zoomer avec la molette et basculer entre les modes de visualisation squelette / Ball & Stick / Space Fill.

Du point de vue des propriétés physico-chimiques, le coefficient de partage logP = 4.5 (valeur positive, composé lipophile), surface polaire PSA = 213 Ų, 4 donneurs et 14 accepteurs de liaisons hydrogène. Ces paramètres sont essentiels pour évaluer la biodisponibilité et l'interaction avec les biomolécules.

Les données chimiques de ce composé proviennent de PubChem (NIH NLM NCBI), l'une des plus grandes bases de données chimiques au monde. Toutes les informations sont mises à jour automatiquement et enrichies de traductions des mentions de danger GHS conformes au règlement CLP (CE 1272/2008). Le modèle 3D interactif et les images de la visionneuse sont protégés par le droit d’auteur (© MolGod.org) — conditions d’utilisation : molgod.org/copyright/.

Propriétés physico-chimiques
Molecular formulaC39H47NO14
Molar mass753.8 g/mol
IUPAC[(7'S,9'E,11'S,12'R,13'S,14'R,15'R,16'R,17'S,18'S,19'E,21'Z)-2',15',17'-trihydroxy-11'-methoxy-3',7',12',14',16',18',22'-heptamethyl-4,6',23',29'-tetraoxospiro[1,3-dioxolane-2,27'-8,30-dioxa-24-azatetracyclo[23.3.1.14,7.05,28]triaconta-1(28),2,4,9,19,21,25-heptaene]-13'-yl] acetate
SMILESC[C@H]1/C=C/C=C(\C(=O)NC2=CC3(C4=C(C2=O)C(=C(C5=C4C(=O)[C@](O5)(O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]1O)C)O)C)OC(=O)C)C)OC)C)C)O)OCC(=O)O3)/C
InChIKeyRAFHKEAPVIWLJC-KQOHHTLASA-N
logP (XLogP3)4.5
PSA213 Ų
HBD / HBA4 / 14
PubChem CIDCID 5280468 ↗
Sécurité GHS

Mention d'avertissement: Attention

GHS08
GHS08
GHS09
GHS09

H371 — Risque présumé d'effets graves pour les organes.

H400 — Très toxique pour les organismes aquatiques.

H410 — Très toxique pour les organismes aquatiques, entraîne des effets néfastes à long terme.

Littérature scientifique

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Data from PubMed (NIH NLM), OpenAlex (CC0), Semantic Scholar (AI2). AI Summary generated by Semantic Scholar TLDR. Articles marked with require paid access.

Synonymes
Rifamycin O · 14487-05-9 · Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone · CHEBI:16324 · NSC-182391 · RefChem:930767 · DTXCID801766108 · 238-493-1 · Z67LEM9P1W · RIFAMYCIN-O · C39H47NO14 · NSC182391 · SCHEMBL18494827 · SCHEMBL30665627 · RAFHKEAPVIWLJC-KQOHHTLASA-N
Sources des données
Molécules apparentées
📜 Licence et provenancePREDICTED MODEL · NOT VERIFIEDMolGod_License_1
PREDICTED MODEL — NOT VERIFIED
computed by MolGod Scientific · experimental feature (beta) · may contain errors

No source 3-D conformer was available to MolGod for this substance. MolGod Scientific computed this geometry from the structural formula with RDKit 2026.03.6 (ETKDGv3 conformer generation, MMFF94 force-field optimisation; lowest-energy converged conformer of a fixed-seed set). It is not a measured structure, it does not come from PubChem, and it has not been compared with experimental data. It shows one possible conformation.

1 stereo element(s) undefined in the source record (1 stereocentre(s), 0 double-bond E/Z) were assigned arbitrarily; the model shows one stereoisomer only, which may not be the naturally occurring or commercial form.

Methods and references
  1. RDKit: Open-source cheminformatics, version 2026.03.6. Zenodo. doi:10.5281/zenodo.22140358 (all versions: doi:10.5281/zenodo.591637)
  2. Riniker S, Landrum GA. Better Informed Distance Geometry: Using What We Know To Improve Conformation Generation. J. Chem. Inf. Model. 2015, 55, 2562-2574. doi:10.1021/acs.jcim.5b00654
  3. Wang S, Witek J, Landrum GA, Riniker S. Improving Conformer Generation for Small Rings and Macrocycles Based on Distance Geometry and Experimental Torsional-Angle Preferences. J. Chem. Inf. Model. 2020, 60, 2044-2058. doi:10.1021/acs.jcim.0c00025
  4. Halgren TA. Merck molecular force field. I. Basis, form, scope, parameterization, and performance of MMFF94. J. Comput. Chem. 1996, 17, 490-519. doi:10.1002/(SICI)1096-987X(199604)17:5/6<490::AID-JCC1>3.0.CO;2-P
  5. Tosco P, Stiefl N, Landrum G. Bringing the MMFF force field to the RDKit: implementation and validation. J. Cheminform. 2014, 6, 37. doi:10.1186/s13321-014-0037-3
  6. Heller SR, McNaught A, Pletnev I, Stein S, Tchekhovskoi D. InChI, the IUPAC International Chemical Identifier. J. Cheminform. 2015, 7, 23. doi:10.1186/s13321-015-0068-4
  7. Kim S, Chen J, Cheng T, et al. PubChem 2025 update. Nucleic Acids Res. 2025, 53, D1516-D1525. doi:10.1093/nar/gkae1059 Compound record: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/5280468
  8. Bolton EE, Kim S, Bryant SH. PubChem3D: Conformer generation. J. Cheminform. 2011, 3, 4. doi:10.1186/1758-2946-3-4 (cited for contrast: no source 3-D conformer was available to MolGod for this record)
Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone (CAS 14487-05-9), C39H47NO14 - 3D ball-and-stick molecular model, engraved element symbols (C H N O), MolGod STL previewTélécharger l’image

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Modèle
Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone · 14487-05-9
InChIKey
RAFHKEAPVIWLJC-KQOHHTLASA-N
Licence
CC BY-SA 4.0 International (droits sur la source indéterminés — pas encore accordée)
Attribution
MolGod Scientific — Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone (CAS 14487-05-9)
Fiche de licence et de provenance
Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone (CAS 14487-05-9) →
Fiche moléculaire MolGod
Rifamycin, 4-O-(carboxymethyl)-1-deoxy-1,4-dihydro-4-hydroxy-1-oxo-, gamma-lactone →
Données source
PubChem CID 5280468 ↗
Informations sur le modèle
STL généré par MolGod · MolGod STL Exporter build 48804cd20b0d · généré le 2026-10-14
SHA-256 (STL)
d1699aad7ebe6f093cd332b65f67dea0e44e58af9cc3c0c57f270fda546c792a
MD5 (STL)
4159652f3f13ced65c68b17c21e9f807
Identifiant du modèle
MG-STL-14487-05-9
Transformation
Maillage boules-et-bâtonnets MolGod Scientific
Modifications
PREDICTED geometry computed by MolGod Scientific (RDKit), NOT verified; rendered as a triangulated mesh.
Wikimedia Commons
pas encore publié

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